История создания Диагностического центра в Иркутске началась в сентябре 1993 года, когда Борис Александрович Говорин (тогда — мэр Иркутска) издал соответствующее распоряжение. Реализация этого проекта была поручена Ушакову Игорю Васильевичу (тогда - ассистент кафедры факультетской терапии ИГМИ). В начале Диагностический центр планировался как небольшое учреждение на 10–15 кабинетов, но по мере изучения опыта организации и работы центров за рубежом и России, стало ясно, что этим не обойтись.
Весьма интересна история здания, в котором сейчас находится Диагностический центр. Его строительство началось в 80-х годах и в начале планировалось построить большой универсам, однако перестройка завершалась, денег в бюджете не было, и в 1993 году здание было включено в программу приватизации объектов незавершенного строительства. Удачное расположение здания вблизи основных транспортных артерий, практически в центре города привлекло многих потенциальных покупателей. Но за 2 недели до выставления здания на торги в январе 1994 года, Б. А. Говорин подписал распоряжение о перепрофилировании его под Диагностический центр.
Предварительные расчеты затрат на реконструкцию здания и приобретение диагностического оборудования показали, что городской бюджет не в состоянии профинансировать их. Начались поиски источников финансирования. В 1994 году состоялась встреча руководителя Хабаровского представительства известной японской фирмы «Марубени корпорейшн» господина Фудзии, находящегося с деловым визитом в Иркутске с Б.А. Говориным, на которой впервые обсуждалась возможность привлечения части гуманитарного 500-миллионного кредита (в долларах США) Эксимбанка Японии для финансирования нашего проекта. Основным условием Б.А. Говорина было возможность использования части кредита на строительные работы. Фирма «Марубени», вначале отказавшись рассматривать такую возможность, в дальнейшем провела большую работу в Правительстве Японии и в Эксимбанке, результатом которой стал решение о возможности использования части кредита на строительные работы, при условии, что они будут выполняться не российскими строительными компаниями.
Администрация Иркутска приняла решение о привлечении к строительству фирмы «Ксемитрейд» (Кипр), построившей к тому времени бизнес-центр и центральный рынок в Иркутске. По поручению мэра,, Ушаковым И.В. был подготовлен и направлен в заинтересованные ведомства (Минфин, Минздрав, Минэкономики, Внешэкономбанк, Госкомоборонпром, МВЭС и пр.) весь необходимый пакет документов. Первый ответ из Минфина был не утешительным — на всю сумму кредита уже подано заявок на 550 млн. долларов.
Однако работа продолжалась. В итоге в 1996 году было подписано распоряжение Правительства РФ о целесообразности привлечения кредита Эксимбанка в 16,15 млн. долларов США для финансирования строительства и оснащение медицинским оборудованием Диагностического центра в Иркутске. Благодаря экспертизе Торгово-промышленной палаты Восточной Сибири удалось уменьшить цену на медицинское оборудование на сумму около 4 млн. долларов, увеличить срок гарантийного обслуживания до 1,5 лет и включить в контракт пункт, позволяющий Центру непосредственно до поставки оборудования заменить его на более современное без изменения цены. В октябре контракт был заключен. В июне 1997 года было подписано индивидуальное кредитное соглашение по проекту, а ноябре был заложен первый кирпич в реконструкцию здания под диагностический центр.
С тех пор пришлось преодолеть еще много трудностей, решить много проблем, был и дефолт 17 августа 1998 год, и война в Югославии, но все участники проекта и управление капитального строительства (начальник Луковников Александр Иванович), и фирма Ксемитрейд (президент Ксения Мичович), и фирма Агродорспецстрой (президент Голышев Валентин Александрович) приложили много сил для его успешного завершения. В результате только проект Иркутского диагностического центра из всей 500-миллонной кредитной линии Эксимбанка Японии реализован.
10 июля 1999 года Диагностический центр был торжественно открыт, а уже 12 июля принял первых пациентов.
10 января 2000 года Диагностический центр получил статус областного.
